Итак, с того момента, как Пейн и Акацуки напали на Коноху, прошло 20 лет. Что же произошло после того, как появился Наруто? Конечно же, ему удалось победить Пейна. Это заняло у него не мало сил, но все же нукенин был мертв. Благодаря другим шиноби Конохи им удалось защитить деревню. Конечно же, было много жертв, но общими усилиями Коноху удалось востановить.
Что же произошло с акацуками? После того, как Селение Листвы показала свою силу, организация распалась из-за смерти одного из своих лидеров. Учиха, уверенный в смерти своего брата, но в то же время беспомощный по отношению к Конохе, вернулся в Ото и начал довольно мирную жизнь с новоиспеченной невесткой Карин. Остальные Акацуки начали странствовать по миру шиноби, зарабатывая на миссиях и спасаясь от правительства.
Что же происходило в Селении Скрытого Листа? Пятая Хокаге, Туснаде, после битвы с Акацуками была в очень плохом состоянии. Именно тогда и назначила Наруто свои помощником, чему Узумаки был несказанно рад. В других деревнях все было спокойно. В этих мирных отношениях между странами прошло двадцать лет. Главные герои давно уже завели семью и детей, Тсунаде -химе ушла на пенсию, предоставив свой пост Наруто.
Но в это же время, вроде бы успокоенный выполнением своей мести, Учиха Саске узнает странную новость... Оказывается, в деревне не далеко от Ото появилась новая таинственная организация, название которой неизвестно. Но ее лидер, молодая девушка, говорит, что находится в клане Учиха... Нет, это не ложь. Мало кто знал, что в юности Итачи был довольно влюбчивым и страстным молодым человеком... Девушка, родившая от Итачи дочь, воспитывала ее к неновисти к ее клану, говоря ей, что они бросили ее, и ей нужно отмстить, а так же уничтожить деревню своего отца. Конечно же, девушка решила выполнить свою цель... И вот теперь направляется к Конохе (узнав об организации, там объявлено военное положение), ну и, по пути собираясь зайти в Ото...
Чтоже делает Саске, чтобы защитить свою семью, которой предстоит возродить свой клан? Учиха, уже давно подумывавший о переезде в родную деревню, отправляет своего сына в Коноху, чтобы помочь им, а сам решает встретится с новоиспеченной родственницей...